示例报告 · Demo Data · 籼稻 vs 粳稻 · 48 样本
将 VCF 文件、样本分组表和基因注释 GFF 上传至 GeneSpeeds Reseq Report。变异质控包括 SNP/InDel 数量统计、缺失率、杂合率、Ts/Tv 比值。群体遗传分析采用 PLINK v2.0 完成 PCA 和系统发育树，VCFtools 计算 FST、π 和 Tajima's D（窗口 50 kb，步长 10 kb）。
| 指标 | 值 |
|---|---|
| SNP 总数 | 2,847,563 |
| InDel 总数 | 412,890 |
| 平均缺失率 | 3.2% |
| Ts/Tv 比值 | 2.14 |
PCA 显示籼稻与粳稻沿 PC1 轴（38.7% 方差）清晰分离。FST 滑窗在 Chr7:0.8–1.3 Mb 检测到最强分化信号（FST = 0.71）。
| 基因 | 功能 | 优先级 |
|---|---|---|
| Os07g0152000 | 开花时间调控 / 籼粳分化候选 | 高 |
| Os03g0417700 | 粒型发育相关 | 高 |
完整交互版报告请访问 https://www.genespeeds.com/reseq/demo-report